
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物制品 为其提供 TMT球蛋白组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
科学研究结论
研发员工研究性渐渐冷冻时光提高鸡肉的坚硬程度、持水利、色调、存在铁含碳量、ROS、脂质过腐蚀物、MDA、GSH和GPX4含铁来评定相关肌肉聚集神经细胞膜的铁去世睡眠状态。最终结果展示,冷冻时光提高后,鸡肉的坚硬程度在第六天和第6天明显急剧下降;持水力量大幅度降低;颜色等等变深,丧失油润,鲜红白色就来为暗红白色。还有就是,存在铁、活性酶氧和MDA的含碳量明显延长,神经细胞膜凋亡率明显提升。 深入研究工作员分离出来各种不一要在冷藏室保存事件的相关肩部肌肉合格品的蛋清质,以后开展SDS-PAGE研究,蛋清质条带在各种不一时间占比透亮且同类(图1a)。依照蛋清在各种不一合格品中的传达实际情况,研究挖掘不同组合格品的中个数将近于不同平均水平(图1b),阐明相关肩部肌肉合格品蛋清质包括充分的组内同类性和组间文化能力差异聊天。 蛋清质组学共亲子认定出1996种蛋清质。以B0为比较组,挑选B1、B2、B4和B6中的蛋清做出差距描述剖析,共亲子认定到37几个DEPs。将火山图交互式,并会根据FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两只细则剖析DEP。没想到长为1c-f已知,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别亲子认定出22、33、73和140个DEPs,至少分刘海别上涨6、11、32和8八个,降低16、22、41和53个。聚类分析法具体方法测评了各种不同保鲜冷库环节身体背部肌肉策划 中蛋清质的描述,没想到表现身体背部肌肉蛋清描述差距跟随着储藏时间间隔的加入而加入(图1g)。
图1| 有所差异速冻時间的健身肌肉样件球蛋白质含量组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不同的要在冷藏室保存日子的健身肌肉仿品相互影响淀粉酶概述(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消失蛋白质肽的PRM酶联免疫法数据分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 系统设计KEGG丰度性别差异表答核蛋白的铁死管理机制(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱个人总结
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱动物提供了TMT参考值淀粉酶质组学技能提供提供服务,拜谱生物体已研发部门完毕并建造了落实成长的转录组学、淀粉酶组学、新陈代谢组学及其两组学联办设备技能提供提供服务采集体系,欢迎致电咨询!
参看论文参考文献:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.